1、电子显微镜是比较脆弱的仪器，电子显微镜最重要的当地便是镜头了，镜头不能够摔，放的时候要轻拿轻放，用完今后也要放在安全的当地。要确保实验室的清洁。
2、假如条件允许的情况下，能够放到无尘环境下，实验室里不能够有尘埃，避免镜头上粘有尘埃，影响调查作用。空气保持枯燥，常常通风、或者运用空调，假如实验室太湿润，那么电子显微镜的镜头就会腐蚀。
3、不能够在有轰动的当地放置，常常在有轰动的当地简单导致观看不，影响调查作用，所以尽量保持在固定的当地调查。
4、电子显微镜的电压也要保持输入电压在220V、输入电压5V，上下动摇不能够太大，假如大大，可能导致烧坏显微镜。温度尽量在0度——30度之间，温度太低也不可，太高也不可。
5、电子显微镜的中心部分非专业人士不能拆开，电子显微镜的光源也很重要，确保亮度要一向，切勿忽高忽低，影响调查作用，导致眼睛疲劳。运用过光源今后要关掉，不能直接把插销，应先关开关，然后再把电源。
6、当电子显微镜运用完毕时，必定要把倍数调成状态，这样一是便利下次运用，二是确保镜头
7、电子显微镜的支架也要留意，不要随意移动，运用完毕后不要马上把防尘罩罩上，让显微镜和光源的温度降下来，然后在罩上（防尘）。再次着重假如有技术上的问题无法处理，必定不要私自拆开，应该找专业人士处理。以上几点留意好，电子显微镜的运用寿命就会变长。
